Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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PGGT1BP53609 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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