Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNA2P51530 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNA2P51530 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNA2P51530 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNA2P51530 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNA2P51530 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNA2P51530 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNA2P51530 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNA2P51530 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNA2P51530 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNA2P51530 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms