Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms