Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC34P49427 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC34P49427 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC34P49427 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC34P49427 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms