Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms