Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5G3P48201 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5G3P48201 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms