Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL35P42766 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL35P42766 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms