Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPOP42166 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPOP42166 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPOP42166 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPOP42166 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPOP42166 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPOP42166 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms