Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX11P35716 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX11P35716 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX11P35716 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX11P35716 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX11P35716 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms