Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms