Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCAP28676 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCAP28676 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms