Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLD1P28340 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms