Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms