Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms