Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSMA5P28066 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms