Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4AP27815 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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