Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMLP26374 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMLP26374 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMLP26374 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms