Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms