Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2P22307 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCP2P22307 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCP2P22307 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCP2P22307 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2P22307 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2P22307 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2P22307 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms