Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms