Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRB1P17538 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms