Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms