Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPCAMP16422 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms