Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCSHP14314 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCSHP14314 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms