Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms