Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms