Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM2P0DP24 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM2P0DP24 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms