Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM10L1P0DMW3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM10L1P0DMW3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms