Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VIL1P09327 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIL1P09327 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIL1P09327 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIL1P09327 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms