Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA4P06727 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA4P06727 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA4P06727 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA4P06727 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA4P06727 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA4P06727 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA4P06727 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA4P06727 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA4P06727 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA4P06727 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms