Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOC3P02656 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC3P02656 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms