Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINC1P01008 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms