Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM2O94769 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM2O94769 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM2O94769 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms