Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KA4O75676 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms