Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms