Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLO75128 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLO75128 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLO75128 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLO75128 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLO75128 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLO75128 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLO75128 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLO75128 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLO75128 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLO75128 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms