Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH3O43739 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms