Protein–RNA interactions for Protein: O15353

FOXN1, Forkhead box protein N1, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN1O15353 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXN1O15353 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms