Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms