Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASKO14936 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASKO14936 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASKO14936 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms