Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms