Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
B4DXG7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
B4DXG7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
B4DXG7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DXG7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DXG7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DXG7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms