Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms