Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms