Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms