Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPREP23469 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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