Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms