RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.98■■□□□ 1.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.24■□□□□ 0.67
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RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18■□□□□ 0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNA4P22459 653 aa17.85■□□□□ 0.45
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RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC4A2P04920 1241 aa16.29■□□□□ 0.2
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RNU6-334P-201ENST00000517072 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
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RNU6-334P-201ENST00000517072 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.18□□□□□ -0.14
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RNU6-334P-201ENST00000517072 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.9□□□□□ -0.18
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLHL34Q8N239 644 aa13.88□□□□□ -0.19
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RNU6-334P-201ENST00000517072 PKD2Q13563 968 aa13.62□□□□□ -0.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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RNU6-334P-201ENST00000517072 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
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RNU6-334P-201ENST00000517072 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 GSE1Q14687 1217 aa13.52□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM41Q8WV44 630 aa13.52□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHADLQ6NUI6 762 aa13.49□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM212AQ96EL1 285 aa13.48□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.43□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.43□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.4□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 RASEFQ8IZ41 740 aa13.4□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 RGL2O15211 777 aa13.34□□□□□ -0.27
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