Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TUBB4BP1-201ENST00000545422 178 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC005394.1-201ENST00000589999 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.159-201ENST00000612585 265 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC007603.2-201ENST00000623281 506 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LINC01104-202ENST00000452354 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 L3MBTL3-203ENST00000368139 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 NFRKB-201ENST00000446488 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 EFR3B-204ENST00000403714 7434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LINC00654-201ENST00000379053 6113 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC005358.2-201ENST00000584772 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SERPINB7-201ENST00000336429 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 GDF9-205ENST00000621295 1939 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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