Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 OVGP1-201ENST00000369732 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF2-207ENST00000609692 2210 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAMP2-AS1-205ENST00000592670 3118 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF11-203ENST00000575082 2315 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF608-210ENST00000613878 3190 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACKR1-204ENST00000537147 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPEB1-208ENST00000611163 1919 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFAND4-202ENST00000344646 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVEP1-201ENST00000374461 3257 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 STYK1-201ENST00000075503 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH2D4B-202ENST00000339284 3983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CATSPER1-201ENST00000312106 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAK3-212ENST00000519681 2638 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 C3orf67-206ENST00000472469 4108 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSGALNACT2-201ENST00000374466 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIST1H3J-201ENST00000359303 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms